Kartu misterius turun dari langit suatu hari. Mampu memanggil makhluk kuat dari dimensi lain, mereka menjadi pusat permainan baru bernama Bakugan. Gim ini mendapatkan popularitas instan di kalangan anak-anak dan remaja, dengan yang terbaik dari mereka bersaing di peringkat dunia.
Sementara itu, perang untuk menguasai Vestroia, tanah air kartu Bakugan, terus berkecamuk. Diserang oleh Naga Naga Putih dan para pelayannya, Doom Beings, alam menjadi semakin tidak stabil. Dimensi mulai menyatu dan banyak pemain Bakugan menyadari bahwa hobi mereka bukan hanya permainan.
Danma Kuusou, salah satu pemain Bakugan tersebut, berniat menjadi pemimpin Peringkat Dunia suatu hari nanti. Namun, dalam salah satu pertarungannya, dia mengalami penglihatan tentang bentrokan di Vestroia. Pertarungan tiba-tiba pindah ke Bumi, di mana Danma memiliki Bakugan api yang berbicara dan perkasa, Pyrus Dragonoid.
Dia segera terseret ke dalam konflik, dan bersama dengan tim Bakugan Brawlers-nya, harus melintasi dimensi dan memulihkan keseimbangan di dunia yang porak poranda.
